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雙脫氧氣鏈終止法標定DNA序列操作
日期:2025-06-15 04:36
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摘要:
雙脫氧氣鏈終止法標定DNA序列操作
DNA聚合酶催化的DNA鏈延伸是在3’-OH末端向上行的。因為2’,3’-雙脫氧氣三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脫氧氣而錯過游離-OH,當它參入到DNA鏈后,3’-OH末端消逝,使DNA鏈的延伸終止真空干燥箱。
本實驗依據此原理,將待測DNA斷片**去單鏈噬菌體M13載體,并用合成的寡聚核苷酸引物與該載體上**去待測斷片的上游順著次序退火,隨即在T7DNA聚合酶催化下施行延伸反響。實際操作中同時施行,作別終止于A、G、C和T的4個反響整體體系。每個反響整體體系均含4種脫氧氣三磷酸核苷酸(dNTP)底物,那里面—種dATP為32P標記物,以便能用放射自顯影法讀序。但在這4個反響整體體系中,作別加一種低液體濃度的ddNTP(ddATP、ddGTP、ddCTP或ddTTP),這么ddNTP可隨機參入正在延伸的DNA鏈上,使鏈延伸終止。例如在“A”管中加ddATP,反響終了時,管內全部新合成的DNA鏈都是以A結末的不一樣長度的斷片,并且這些個斷片都帶放射性。將反響物加在高辯白凝膠上電泳,DNA斷片則因其長度不一樣(分子量體積不一樣)被離合電熱恒溫鼓風干燥箱,短的走在前端,長的泳動在后面。其它3管則作別為以G,C或T結末的不一樣長度DNA斷片。
因為:①縱然是參差相差一個核苷酸的DNA斷片,亦可依據其電泳距離的差別而加以區(qū)別;②A、G、C和T4種反響整體體系的產物在電泳凝膠中相鄰排列。因而在閱覽凝膠電泳的放射自顯影圖像時,由下至上按前后順著次序即可將DNA的核苷酸順著次序讀出。